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CLIP （crosslinking-immunoprecipitation）是利用蛋白質和RNA在365nm紫外光照射下會發生共價交聯的特性，來研究蛋白質和RNA相互作用的重要技術。

GST pulldown是一項體外檢測蛋白質之間直接互作的有效方法，能有效驗證酵母雙雜交系統體外實驗，可用于檢測已知或推測的蛋白-蛋白相互作用，也可作為未知的蛋白-蛋白相互作用的初始篩選方法。

RNA甲基化指發生在RNA分子上不同位置的甲基化修飾現象，屬于轉錄后修飾，常見的甲基化修飾方式有6-甲基腺嘌呤(N6-methyladenosine，m6A)和5-甲基胞嘧啶(C5-methylcytidine，m5C)以及7-甲基鳥嘌呤(N7-methylguanosine，m7G)等。RNA甲基化在調控基因表達、剪接、RNA編輯、RNA穩定性、控制mRNA壽命和降解、介導環狀RNA翻譯等方面可能扮演重要角色。利用甲基化RNA免疫共沉淀(Methylated RNA Immunoprecipitation，MeRIP)技術，可以對RNA轉錄后甲基化修飾圖譜進行全面研究。

RNA甲基化指發生在RNA分子上不同位置的甲基化修飾現象，屬于轉錄后修飾，常見的甲基化修飾方式有6-甲基腺嘌呤(N6-methyladenosine，m6A)和5-甲基胞嘧啶(C5-methylcytidine，m5C)以及7-甲基鳥嘌呤(N7-methylguanosine，m7G)等。RNA甲基化在調控基因表達、剪接、RNA編輯、RNA穩定性、控制mRNA壽命和降解、介導環狀RNA翻譯等方面可能扮演重要角色。利用甲基化RNA免疫共沉淀(Methylated RNA Immunoprecipitation，MeRIP)技術，可以對RNA轉錄后甲基化修飾圖譜進行全面研究。

線粒體DNA(Mitochondrial DNA,mtDNA)是線粒體內獨立于細胞核存在的、具有閉合環狀結構的雙鏈DNA分子。線粒體基因組為多拷貝基因組，mtDNA的數量(拷貝數)和質量與線粒體功能密切相關。研究表明，mtDNA拷貝數變異引起線粒體功能紊亂，進而導致疾病發生。

N4-乙酰胞苷(N4-acetylcytidine，ac4C)是一種高度保守的RNA乙酰化修飾，其廣泛存在于真核和原核生物的tRNA、rRNA和mRNA中，與多種人類疾病、尤其是癌癥顯著相關。RNA乙酰化在調控蛋白翻譯啟動與延伸、增強蛋白翻譯準確性、改善mRNA穩定性和翻譯效率等方面可能扮演重要角色。