CLIP(crosslinking-immunoprecipitation)實驗是一種用于研究RNA與蛋白質相互作用的強大技術,廣泛應用于識別和解析RNA-蛋白質復合物的組成及其作用機制。通過該技術,研究者能夠捕捉到在生物學過程中,特別是在RNA修飾、RNA剪接和RNA穩定性等方面RNA結合蛋白(RBP)與RNA之間的相互作用。
實驗原理:
CLIP(交聯免疫沉淀)實驗是一種用于研究RNA與蛋白質相互作用的技術,通過交聯RNA和RNA結合蛋白(RBP)之間的物理接觸,并利用免疫沉淀來富集和分析這些RNA-蛋白質復合物;PAR-CLIP 是 CLIP(交聯免疫沉淀)實驗的一種改進方法,結合了光激活的核糖核苷(通常是 4-thiouridine (4SU) 等)技術,能夠更加高效、精確地捕獲 RNA 與蛋白質之間的相互作用。
CLIP-qPCR(crosslinking-immunoprecipitation and qPCR)是通過免疫共沉淀RBP-RNA復合物,獲取純化及消化(蛋白酶K、DNaseI、RNase T1)后的RNA,并通過對RNA 3’-端加接頭和設計不同位點的引物,進行RNA結合蛋白位點的富集效率檢測。
CLIP-seq(crosslinking-immunoprecipitation and High throughput sequencing)是通過免疫共沉淀RBP-RNA復合物,獲取純化及消化(蛋白酶K、DNaseI、RNase T1)后的RNA,進行cDNA文庫構建與測序分析。
產品優勢:
1.伯信獨立研發。
2.紫外照射有效促進細胞內RNA與相應的RNA結合蛋白交聯,增強RNA與蛋白的結合能力。
3.可檢測多種RNA,如LncRNA、mRNA、microRNA。
4.CLIP-qPCR可精確定位RNA與蛋白的結合位點。
技術流程:
結果實例:
文章案例
Periodicals:Cancer Communications (London, England)
IF:24.900
Periodicals:International Journal of Biological Sciences
IF:10.000
Article:m5C-modified circRREB1 promotes lung cancer progression by inducing mitophagy.
Periodicals:Journal of Experimental & Clinincal Cancer Research: CR
IF:12.800
Periodicals:Stem Cell Research & Therapy
IF:7.100
Article: o8G-modified circPLCE1 inhibits lung cancer progression via chaperone-mediated autophagy.
Periodicals:Molecular Cancer
IF:27.700
Periodicals:Cell Biology and Toxicology
IF:5.300
Periodicals:Communications Biology
IF:5.200
Article: Linc00673-V3 positively regulates autophagy by promoting Smad3-mediated LC3B transcription in NSCLC.
Periodicals:Life science alliance
IF:3.300
Periodicals:Cell death discovery
IF:6.100
Article:YBX1 promotes type H vessel-dependent bone formation in an m5C-dependent manner
Periodicals:JCI insight
IF:6.300
Article:The CTBP2-PCIF1 complex regulates m6Am modification of mRNA in head and neck squamous cell carcinoma
Periodicals:The Journal of Clinical Investigation
IF:15.900
Periodicals:Translational Research
IF:10.171



